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摘要：本论文采取粗粒化分子动力学模拟策略来探讨在低和中性pH条件下，第三代表面修饰短肽的树枝状分子（G3-HHHR）与脂质膜相互作用。短肽包含三个对pH敏感的组氨酸和一个末端的精氨酸。通过模拟，我们发现在中性pH条件下，这类末端修饰短肽的树枝状大分子发生了一定的形变并且吸附于非对称膜的表面，在低pH条件下，由于强烈的静电吸引作用，这类大分子嵌入了带负电的膜中，自身的形状呈哑铃状。这类大分子使下半部分带负电的脂质分子翻转至膜的上半部分，且引起膜变薄进而推动膜渗透现象的发生。我们的探讨为这类的大分子运用于载药和基因输运方面提供了有益的帮助。基于该类分子吸附于膜和致使膜发生渗透现象对pH环境的依赖性，本论文提出了一种可能的利用运载基因来治疗癌症的途径。关键词：树枝状分子论文脂质膜论文表面修饰论文相互作用论文粗粒化分子动力学模拟论文基因输运论文
中文摘要4-5
Abstract5-8
第一章 绪论8-17
1.1 软物质介绍8
1.2 纳米颗粒与细胞膜相互作用的作用8-9
1.3 细胞膜的模型结构和功能9-12
1.3.1 生物膜的组织结构9-10
1.3.2 流体镶嵌模型10-11
1.3.3 脂质筏检测说11-12
1.4 纳米颗粒的结构与性质12-15
1.4.1 树枝形分子和树枝形多肽的结构与性质12-15
1.5 本论文探讨的主要内容15-17
第二章 探讨的目的以及作用17-18
第三章 论述策略18-32
3.1 基本的分子动力学知识18-21
3.2 温度和压强耦合21-24
3.3 系综的介绍24-27
3.4 MARTINI 力场介绍27-32
第四章 末端修饰的树枝形多肽和脂质膜的相互作用32-50
4.1 探讨背景32-33
4.2 模型和探讨策略33-39
4.3 模拟的结果与讨论39-48
4.3.1 两者相互作用后，结构的变化39-45
4.3.2 两者相互作用历程中的动力学信息45
4.3.3 平均力势（PMF）45-46
4.3.4 由于 pH 响应而得到的启发46-48
4.4 结论48-50
第五章 全文总结50-52
5.1 全文总结50
5.2 不足与展望50-52