您的位置: turnitin查重官网> 经济 >> 农业经济管理 >简析遗传日本沼虾不同地理群体遗传多样性和分子标记鉴别工作

简析遗传日本沼虾不同地理群体遗传多样性和分子标记鉴别工作

收藏本文 2024-02-16 点赞:13844 浏览:51816 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:日本沼虾(Macrobrachium nipponense)自然分布于中国、日本、越南以及缅甸等地区,广泛分布于我国各地淡水水域。这一物种资源量在长江中下游地区是非常丰富的,特别是太湖地区。该品种在中国和日本是重要的淡水经济虾类。近年来,由于过度捕捞,自然栖息地的退化使得日本沼虾野生群体的种群遗传结构和资源量急剧下降。因而开展遗传多样性分布和野生群体遗传结构的探讨对制定保护措施显得尤为重要。利用ISSR分子标记技术对江苏长江和太湖2个地区日本沼虾群体的遗传多样性进行了浅析。结果显示:75个ISSR引物中有6个引物能扩增出清晰条带,6个引物对两个群体各24个样品扩增出34个位点。日本沼虾长江和太湖两群体的多态位点比率为76.47%和73.53%,Shannon's(?)旨数分别为0.3480和0.3465,Shannon's指数估算和AMOVA浅析均显示日本沼虾的遗传变异主要来自于群体内个体间。日本沼虾UPGMA系统树基本依据不同群体分别聚类,体现出一定的遗传趋异。结果表明:两个地区日本沼虾群体的遗传多样性处于较高水平;日本沼虾江苏地区长江和太湖两个群体间有着一定的遗传分化。采取AFLP技术分别对太湖、长江日本沼虾群体各30尾的基因组DNA进行了群体特异性位点比对浅析,并对各位点基因频率分布进行正态性检验、方差齐性检验(F检验)、样本平均数差别显著性检验(t检验)。结果显示:3对引物共扩增出138个位点;太湖组是独立于长江组的群体,而且它们是两个分化了的野生群体;采取变异性的显著性检验(x2检验)对位点进行差别比较发现,23个位点在太湖组中出现的频率显著高于长江组,其中位点BY160、BY320、BY470、 BY520是与太湖群体分化显著关联的位点,可作为区别太湖野生群体与长江野生群体的标记。对我国江苏省4水域日本沼虾40个野生个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)部分序列进行了测定和浅析。经比对获得640bp核苷酸片段,发现36个变异位点,得到19个单倍型,包括4个共享单倍型,各群体都具有较好的单倍型多态性和核苷酸多态性,其中太湖和长江群体遗传多样性相对较高。MEGA3.1软件计算4群体的Kimura2-parameter遗传距离,长江群体和太湖群体之间的遗传距离最远为0.014,太湖群体和里下河群体之间的遗传距离最近为0.002。以同属其他沼虾为外群分别构建了NJ和UPGMA系统树.结果显示长江为一族群,太湖、里下河和洪泽湖为一族群。关键词:日本沼虾论文ISSR论文AFLP论文COI遗传多样性论文遗传分化论文特异性位点论文

    摘要3-4

    Abstract4-9

    第一章 绪论9-18

    1.1 引言9

    1.2 日本沼虾的探讨概况9-10

    1.2.1 日本沼虾主要形态特点与细胞遗传学探讨9-10

    1.2.2 日本沼虾生态学探讨10

    1.3 运用分子标记对水产动物群体遗传学探讨进展10-13

    1.3.1 分子标记运用于群体遗传多样性探讨10-11

    1.3.2 水产动物种质鉴别与分类的分子标记探讨11-12

    1.3.3 水产动物选择育种的标记浅析12-13

    1.4 常用的DNA分子标记技术13-15

    1.4.1 随机扩增加态性DNA(random ampippfied popmorphic DNA,RAPD)13

    1.4.2 DNA序列测定(以线粒体DNA:mitochondrial DNA,mtDNA基因序列为例)13-14

    1.4.3 简单重复序列区间标记技术(inter-simple sequence repeat,ISSR)14

    1.4.4 扩增片段长度多态性技术(ampfied fragment length polymorphi,AFLP)14-15

    1.4.5 其他新兴分子标记15

    1.5 本论文的主要探讨内容、技术路线和探讨作用15-18

    1.5.1 本论文的主要探讨内容15-16

    1.5.2 本论文的主要技术路线16-17

    1.5.3 本论文的探讨作用17-18

    第二章 不同群体日本沼虾遗传多样性的ISSR浅析18-31

    2.1 引言18

    2.2 材料与策略18-22

    2.2.1 材料18-19

    2.2.2 实验试剂19

    2.2.3 实验器材19-20

    2.2.4 实验策略20

    2.2.5 ISSR浅析20-22

    2.3 结果22-29

    2.3.1 日本沼虾模板DNA的提取22-23

    2.3.2 引物筛选和正交试验23

    2.3.3 ISSR-PCR扩增反应23-26

    2.3.4 日本沼虾群体的遗传多样性浅析26-27

    2.3.5 群体间遗传距离和聚类浅析27-29

    2.4 讨论29-31

    2.4.1 群体遗传多样性水平29-30

    2.4.2 群体遗传分化浅析30-31

    第三章 日本沼虾太湖、长江水域群体分化的AFLP标记差别浅析31-38

    3.1 引言31

    3.2 材料与策略31-32

    3.2.1 样本与材料处理32

    3.2.2 AFLP浅析策略32

    3.2.3 数据统计与浅析32

    3.3 结果32-36

    3.3.1 AFLP选择性扩增带型结果32-33

    3.3.2 太湖、长江群体基因频率的统计浅析33-36

    3.4 讨论36-38

    3.4.1 群体独立性浅析36-37

    3.4.2 太湖群体特异性地域分化位点浅析37-38

    第四章 日本沼虾不同地理群体线粒体COI基因片段浅析38-49

    4.1 引言38-39

    4.2 材料与策略39-42

    4.2.1 实验材料39-41

    4.2.2 实验策略41-42

    4.3 结果42-47

    4.3.1 序列特性42-43

    4.3.2 四群体间的联系43

    4.3.3 系统发育联系43-47

    4.4 讨论47-49

    4.4.1 日本沼虾4群体COI基因部分片段的序列组成和分子进化47

    4.4.2 江苏4群体日本沼虾的亲缘联系47-49

    第五章 结论49-50

copyright 2003-2024 Copyright©2020 Powered by 网络信息技术有限公司 备案号: 粤2017400971号