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谈述性状福建省野生坛紫菜遗传

收藏本文 2024-01-23 点赞:18634 浏览:83116 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:本论文以采自福建省不同海区的8个具有代表性的野生坛紫菜种群的藻体为材料,对其生长特性、品质性状等进行比较浅析,进而利用SRAP分子标记技术对这8个种群进行遗传多样性浅析,探讨野生坛紫菜种群间的遗传变异联系,以期以总体上摸清野生坛紫菜种质资源的遗传背景,为以野生种群选育坛紫菜良种奠定基础。结果如下:在8个种群中,来自WP3和WP6种群的藻体叶片都是线形披针型,藻体色泽鲜艳、生长速度较快,最快时平均日增加5~6cm,而且平均日增重率及藻体厚度也具有较高优势。而种群WP2、WP4和WP5的藻体色泽较暗,生长速度最慢,平均日增加最快也不超过3cm。来源于WP1和WP4种群的藻体不易成熟,在实验室内充气培养15天后,成熟率分别只有37%和35.5%。而来源于WP2种群的藻体在实验室内培养5d后,就有46.5%的藻体成熟。8个种群藻体的色素蛋白、叶绿素、粗蛋白及氨基酸含量均差别显著。其中来源于WP3种群的藻体在粗蛋白、总藻胆蛋白及叶绿素含量上均具有较高优势,而WP6的藻体尽管粗蛋白含量最低,但总藻胆蛋白及叶绿素含量却最高。对于藻体中的氨基酸含量,各种群藻体间也有着较大差别,WP2和WP3藻体的总氨基酸的含量最高,WP5的最低;WP2和WP7藻体的游离氨基酸种类最多,WP5的种类最少。WP1的苏氨酸、丝氨酸和异亮氨酸含量最高,WP2的谷氨酸含量最高;WP3的天冬氨酸、亮氨酸含量最高;WP4的甘氨酸、丙胺酸含量最高;WP8的赖氨酸含量最高。8个种群的藻体都不含脯氨酸;只有WP7含有半胱氨酸,WP5、WP6含有蛋氨酸;而WP3、WP5中不含精氨酸。运用SRAP标记技术对8个野生种群的80个个体进行了遗传浅析,以50个引物组合中筛选出34对可扩增出清晰、重复性好、多态性高的条带。34对引物组合共扩增出1507条带,其中多态性条带1480条,占总数的98.21%。每个引物扩增的位点数为42-48个,平均44.3个,扩增的条带大小在120-1900bp之间。通过对扩增条带的统计浅析,发现三个大种群(东山、平潭、南日)的遗传相似性系数为0.8872-0.8993,平均为0.8931。而东山地区、平潭地区和南日地区各个小种群之间的平均遗传相似性系数分别为0.9489,0.9100和0.9293,均要高于三个地区大种群间的平均遗传相似性系数,尤以东山地区小种群间的平均遗传相似性系数为最高。三个种群内的有效等位基因数、期望杂合度及Shannon多样性指数间差别均为不显著(P0.05),总群体物种水平上每位点的有效等位基因数为1.6862,种群水平上分别为1.7130,1.7095和1.6018;期望杂合度在总群体物种水平上为0.3876,在种群水平上分别为0.4014,0.3992和0.3446;Shannon多样性指数在总群体物种水平上为0.5671,在种群水平上分别为0.5850,0.5815和0.5089,表明坛紫菜种群内有着着较高的遗传多样性水平,且在三个种群间没有显著差别。依据Gst值,坛紫菜种群间的遗传变异较小,种群间的遗传变异只占遗传总变异的12.16%,而87.84%的遗传变异都分布在种群内的个体间,由此说明坛紫菜种群间的遗传分化水平很低,这与坛紫菜种群间充分的基因交流是相关的。东山、平潭、南日三个地区群体间的基因流值(Nm)为3.6124,而三个地区群体内各种群间的基因流值分别为8.7790、4.6987、6.6694,表明坛紫菜各个地区内小种群间的基因交流非常频繁,尽管随着地理距离增大,各地区种群间的基因流值有所减小,但仍然有着着较高的基因交流,这与坛紫菜的生活史特点是相关的。基于Nei’s的遗传距离进行的UPGMA聚类浅析结果显示,坛紫菜总群体80个个体间,除少数个体外,大部分个体都按照其地理来源进行聚类。而在分别对各个地区的小种群内个体间的聚类浅析结果却表明大部分个体都不按照其地理来源进行聚类,而是随机聚类的,而且随基因流值(Nm)的增大,个体间聚类的随机性就越高。关键词:坛紫菜论文生长特性论文经济性状论文SRAP论文遗传多样性论文

    摘要4-6

    Abstract6-12

    第一章 引言12-28

    1.1 探讨背景12-13

    1.2 探讨近况13-15

    1.2.1 坛紫菜经济性状的探讨13-14

    1.2.2 坛紫菜品质浅析的探讨14-15

    1.3 分子标记技术概述15-19

    1.3.1 几种常用的分子标记技术15-18

    1.3.1.1 RFLP分子标记技术16-17

    1.3.1.2 SSR分子标记技术17

    1.3.1.3 AFLP分子标记技术17

    1.3.1.4 ISSR 分子标记技术17

    1.3.1.5 RAPD 分子标记技术17-18

    1.3.2 分子标记技术在植物探讨方面的运用18-19

    1.3.2.1 用于构建高密度的遗传连锁图谱18

    1.3.2.2 在基因定位方面的探讨18

    1.3.2.3 在种质资源鉴定方面的运用18-19

    1.3.2.4 在分子标记辅助育种中的运用19

    1.4 SRAP 分子标记技术介绍19-22

    1.4.1 SRAP 标记技术的原理19-20

    1.4.2 PCR 扩增20

    1.4.3 扩增产物的检测20

    1.4.4 SRAP 标记的运用20-22

    1.4.4.1 在遗传多样性探讨的运用20

    1.4.4.2 在基因定位探讨中的运用20-21

    1.4.4.3 在优势预测探讨中的运用21

    1.4.4.4 在比较基因组学探讨中的运用21

    1.4.4.5 在图谱构建探讨中的运用21

    1.4.4.6 在系统分类中的运用21

    1.4.4.7 在种质鉴定中的运用21-22

    1.4.4.8 在分子标记辅助育种中的运用22

    1.5 分子标记技术在大型海藻探讨中的运用22-26

    1.5.1 分子标记技术在紫菜分子遗传学中的运用22-25

    1.5.2 分子标记技术在其它大型海藻中的运用25-26

    1.6 探讨的目的及作用26-28

    第二章 材料与策略28-37

    2.1 实验仪器28

    2.2 实验材料28-29

    2.3 实验药品及试剂29-30

    2.3.1 常用药品29-30

    2.3.2 常用溶液及银染试剂30

    2.3.3 引物30

    2.4 实验策略30-37

    2.4.1 野生坛紫菜叶状体形态观察及生长特性的比较30-31

    2.4.1.1 形态观察30-31

    2.4.1.2 生长的测定31

    2.4.1.3 叶状体厚度的测定31

    2.4.2 野生坛紫菜粗蛋白质、色素蛋白及氨基酸的测定31-33

    2.4.2.1 粗蛋白质的测定31-32

    2.4.2.2 叶绿素的测定32

    2.4.2.3 总藻胆蛋白的测定32-33

    2.4.2.4 氨基酸的测定33

    2.4.2.4.1 总氨基酸的测定33

    2.4.2.4.2 游离氨基酸的测定33

    2.4.3 基于生长特性及品质的聚类浅析33

    2.4.4 野生坛紫菜的 SRAP 浅析33-37

    2.4.4.1 基因组DNA 的提取33-34

    2.4.4.2 SRAP-PCR 反应因素水平的确定与正交设计34-35

    2.4.4.3 野生坛紫菜基因组 DNA 的 SRAP 标记浅析35

    2.4.4.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳35-36

    2.4.4.5 银染检测36

    2.4.4.6 数据浅析36-37

    第三章 结果与浅析37-58

    3.1 野生坛紫菜叶状体形态及生长特性的比较37-40

    3.1.1 不同生境下野生坛紫菜叶状体的形态特点37

    3.1.2 野生坛紫菜叶状体长度生长情况37

    3.1.3 野生坛紫菜叶状体重量增重情况37

    3.1.4 不同生境下野生坛紫菜叶状体藻体的厚度37

    3.1.5 野生坛紫菜叶状体成熟情况浅析37-40

    3.2 野生坛紫菜品质性状的比较40-42

    3.2.1 不同生境野生坛紫菜蛋白质及叶绿素含量的比较40

    3.2.2 不同生境下的野生坛紫菜氨基酸含量的比较40-42

    3.3 不同种群基于生长特性和品质的聚类浅析42-43

    3.4 野生坛紫菜的 SRAP 浅析43-58

    3.4.1 基因组DNA 提取结果43

    3.4.2 SRAP-PCR 正交实验结果及浅析43-47

    3.4.2.1 电泳结果评分43-44

    3.4.2.2 各因素对 PCR 反应影响的差别浅析44-45

    3.4.2.3 因素内多水平比较浅析45-47

    3.4.2.3.1 引物浓度对 PCR 结果的影响45

    3.4.2.3.2 Taq 酶浓度对 PCR 结果的影响45-46

    3.4.2.3.3 Mg~(2+)浓度对 PCR 结果的影响46-47

    3.4.2.3.4 模板 DNA 浓度、dNTP 浓度对PCR 结果的影响47

    3.4.2.4 坛紫菜 SRAP 标记浅析的最佳反应系统47

    3.4.3 SRAP 引物的筛选47

    3.4.4 基因组 DNA 的 SRAP-PCR 扩增47-58

    3.4.4.1 SRAP-PCR 扩增结果47-52

    3.4.4.2 不同野生坛紫菜种群间的遗传多样性浅析52-53

    3.4.4.3 野生坛紫菜种群的遗传结构53-54

    3.4.4.4 聚类浅析结果54-58

    第四章 讨论58-64

    4.1 野生坛紫菜形态特点与生长性状的浅析58-59

    4.2 野生坛紫菜的品质浅析59-60

    4.3 坛紫菜 SRAP 标记反应系统的构建60-61

    4.4 福建省野生坛紫菜种群的遗传多样性61-62

    4.5 福建省野生坛紫菜种群的遗传结构62-63

    4.6 野生坛紫菜种质资源的开发、利用与保护63-64

    结论与展望64-65

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