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谈小体酵母方式生物用于依赖DNA序列核小体定位实验初步如何写

收藏本文 2024-04-05 点赞:21222 浏览:88216 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:核小体是构成真核生物染色质的基本结构单位,它不仅起基本的结构作用,更重要的是通过其在基因组上的定位及其组蛋白复合物的化学修饰调控诸如DNA复制、转录和修复等基因表达历程。核小体定位是在表观遗传学水平上调控基因表达的重要层次。探讨表明,核小体定位主要受两种因素影响,一是DNA序列,二是一些反式作用因子。真核生物复制起始的调控是复制调控的一个重要环节,酵母复制依赖的顺式作用元件称为自主复制序列(ARS),该序列趋向于核小体缺乏区,但其活性并不完全由核小体位置决定,还可能与两侧的序列特点和核小体分布有联系。本论文利用体外组装核小体技术、DNA标记技术等,以酵母ARS为探讨对象,探讨序列特点对核小体定位及自主复制序列活性的影响。具体探讨内容如下:1.测定了酿酒酵母YPH499的生长曲线,在YPD液体培养基中30℃、200r/min振荡培养12-22h的时间段内酵母处于对数生长期,其倍增时间为2.008h。2.分别采取了溶菌酶处理法、蜗牛酶过夜处理法、蜗牛酶反复冻融处理法、珠磨法提取酵母基因组,结果表明:溶菌酶法不能够提取酵母基因组,其他三种策略均能提取出酵母基因组DNA,相比较珠磨法提取的酵母基因组质量高、成本低、时间短且操作简单,是提取酵母基因组DNA的最佳策略。3.利用BrdU标记整合了带有HSV–TK和hENT1基因的酿酒酵母DNA,液体振荡培养14h加入BrdU,分别标记1、3、5h,用DAPI对整个基因组DNA染色,再利用带有FITC荧光标记的抗体检测BrdU,发现标记3h时荧光强度最大,大约55.3%的酵母基因组DNA中渗入了BrdU。4.采取酸抽提的策略以未饥饿处理和经过不同时间饥饿处理的酵母细胞中提取组蛋白,经15%SDS-PAGE电泳检测、Bradford法测定蛋白浓度,结果显示:抽提物中含有组蛋白H1、H2A、H2B、H3和H4,以未饥饿处理的酵母细胞中提取的组蛋白浓度高,但有部分杂蛋白有着;经不同时间饥饿处理的酵母细胞中提取的组蛋白浓度较低,但是杂蛋白含量显著减少;且随着饥饿时间的延长,组蛋白和杂蛋白含量都逐渐减少。5.采取601序列建立体外组装系统及检测策略,将纯化的酵母ARS304、305与纯化的组蛋白八聚体在体外梯度盐透析组装形成核小体,利用EB及Biotin标记检测,结果显示:不同组蛋白八聚体与DNA的比例形成核小体的数量不同,同一比例下ARS304、305形成核小体的能力不同,ARS305较ARS304结合核小体能力强。关键词:核小体定位论文酵母论文自主复制序列论文BrdU标记论文体外组装论文

    摘要5-6

    Abstract6-10

    引言10-12

    1 文献综述12-24

    1.1 核小体及核小体定位12-15

    1.1.1 核小体结构12-13

    1.1.2 核小体定位与基因表达调控13-14

    1.1.3 影响核小体定位的因素14-15

    1.2 酵母15-19

    1.2.1 酵母细胞壁组成及破壁提取基因组策略15-16

    1.2.2 酵母基因组组成16-17

    1.2.3 酵母 ARS17

    1.2.4 酵母基因组标记检测17-18

    1.2.5 核小体定位对酵母 ARS 活性的影响18-19

    1.3 核小体体外组装及检测技术19-24

    1.3.1 组蛋白19-20

    1.3.2 核小体体外组装20-21

    1.3.3 核小体体外组装后的检测21-24

    2 实验材料与策略24-34

    2.1 酵母菌的培养及生长曲线测定24

    2.1.1 材料与策略24

    2.1.2 酵母生长曲线测量24

    2.2 酵母菌基因组的提取与检测24-26

    2.2.1 溶菌酶法24

    2.2.2 蜗牛酶过夜处理法24-25

    2.2.3 蜗牛酶反复冻融法25

    2.2.4 珠磨法25

    2.2.5 提取基因组的检测25-26

    2.3 酵母转化26-27

    2.3.1 材料与策略26

    2.3.2 质粒 p405 的提取26

    2.3.3 酵母感受态细胞制备26

    2.3.4 质粒转入酵母细胞26-27

    2.4 BrdU 标记酵母基因组27-28

    2.4.1 载玻片的预处理27

    2.4.2 提取标记基因组涂片检测27

    2.4.3 琼脂糖固定标记的酵母细胞涂片检测27-28

    2.5 酵母组蛋白提取28-30

    2.5.1 蛋白标准曲线绘制28

    2.5.2 酵母组蛋白提取28-29

    2.5.3 SDS-PAGE 检测29-30

    2.5.4 蛋白含量测定30

    2.6 核小体体外组装30-34

    2.6.1 体外组装系统建立30-31

    2.6.2 酵母 ARS304、305 体外形成核小体31-34

    3 结果与浅析34-45

    3.1 酵母菌生长曲线测定34

    3.2 酵母基因组的提取与检测34-37

    3.2.1 破壁效果比较34-35

    3.2.2 提取的基因组 DNA 的浓度和纯度35-36

    3.2.3 琼脂糖凝胶电泳检测36-37

    3.3 BrdU 标记基因组检测酵母 ARS 复制活性37-38

    3.3.1 提取标记基因组涂片检测37-38

    3.3.2 琼脂糖固定标记的酵母细胞涂片检测38

    3.4 酵母组蛋白提取及检测38-41

    3.4.1 蛋白标准曲线38-39

    3.4.2 组蛋白浓度39

    3.4.3 SDS-PAGE 检测39-41

    3.5 核小体体外组装41-45

    3.5.1 采取 601 序列建立体外组装系统41-42

    3.5.2 ARS304、305 体外组装形成核小体的能力比较42-45

    4 讨论45-47

    结论47-48

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