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摘要：由于蛋白质承载了生命体的各种信息和功能,所有的生命活动都离不开蛋白质以及它们之间的相互作用的参与,同时药物探讨也越来越倾向于在分子水平探讨药物与蛋白质之间的相互作用。在这个大背景下,蛋白质构象的探讨工作变得越来越重要。圆二色性的有着使通过具有光学活性物质的圆偏振光变为椭圆偏振光,且在特定吸收波长处出现。遵循这一原理设计的CD光谱仪可以测定光学活性物质的CD光谱,通过CD谱图可以进一步探讨该光学活性物质的立体构型。蛋白质的肽键在检测波长为190～250nm之间的区间内有圆二色性,蛋白的CD光谱图可以反映蛋白质二级结构的变化。由于蛋白的CD光谱具有对蛋白样品性状要求较低、实验速度较快、重复性好等优点,使CD光谱法成了人们探讨蛋白质构象的常用策略。随着X射线衍射等技术的进步,蛋白数据库(Protein Data Bank)中蛋白结构数据越来越丰富,通过比较发现CD光谱在估算蛋白质二级结构组成中有着较大误差,由此对该策略的质疑越来越强烈。误差产生的理由可能是取得蛋白质CD光谱时的化学环境、仪器条件等影响,也可能是计算拟合策略利用不当,被测蛋白与参考蛋白类型未一致等因素。这些可能的理由利用CD光谱预测蛋白质二级结构组成策略产生较大的误差。为了系统评价CD光谱估算蛋白质二级结构策略的可信度,本探讨选用了蛋白数据库中已有结构数据的七种蛋白：血红蛋白、溶菌酶、肌红蛋白、胰蛋白酶等,进行了两方面探讨,一是转变实验条件收集CD谱,以系统确定CD光谱的收集条件；二是收集了所探讨蛋白的红外光谱,并将CD光谱多种计算策略算得的二级结构数据、红外光谱估算的二级结构数据及蛋白数据库中的二级结构数据进行了比对,并由此评析了CD光谱计算蛋白质二级结构的策略学。本探讨得到以下几个结论：一、CD光谱的合适收集条件是：稳定的室温条件；适当的浓度范围；紫外区透过性佳的缓冲溶液；低盐浓度；适当的测定参数。二、在计算蛋白质二级结构时,CD光谱的平均误差为50%以上,红外光谱的误差平均为10%,红外光谱策略要大大好于CD光谱策略。三、CD策略测定蛋白质二级结构局限性较大,用CD光谱策略计算蛋白质的二级结构只有在某些特定条件下方可实施,如α-螺旋为主的蛋白,溶液系统中干扰物质要少等。实验发现,用CD光谱直接用于预测蛋白质二级结构组成的结果误差太大,圆二色光谱法是一种被广泛错误的运用于蛋白质二级结构组成预测的实验策略。关键词：圆二色光谱论文傅里叶红外光谱论文蛋白质二级结构论文
摘要4-5
Abstract5-6
简写符号6-7
第一章 综述7-42
一、蛋白质二级结构的探讨作用7-8
二、预测蛋白质二级结构的现有策略8-9
三、圆二色光谱法介绍9-18
四、圆二色光谱计算策略介绍18-21
五、傅里叶红外光谱法测定蛋白质二级结构介绍21-28
六、实验目的28-29
七、实验用蛋白质介绍29-36