您的位置: turnitin查重官网> 下载中心 >家蚕非编码RNA在丝腺中表达

家蚕非编码RNA在丝腺中表达

收藏本文 2024-03-22 点赞:15483 浏览:68725 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)是一类不编码蛋白质但有功能的RNA的总称,它们几乎存在于生物体内,在生命活动中发挥着的调控作用,如参与蛋白质合成、染色体复制、RNA的转录及转录后加工、mRNA的稳定和翻译、蛋白质的降解与转运等。家蚕是研究鳞翅目昆虫发育及生理学特征的模式生物,同时做为经济昆虫它还有的经济价值,其丝腺是典型的外分泌腺体,它是合成、分泌丝蛋白的特殊器官,并且具有强大地合成和分泌丝蛋白的能力。长期以来,丝腺家蚕研究的热点,尤其在2004年家蚕基因组测序计划完成后,在丝腺发育的分子机制取得了很大的进展。对家蚕丝腺的研究主要在编码基因,而在非编码上的研究却鲜有报道。在本实验室前期构建家蚕50-500nt的非编码文库的基础上,对家蚕不同发育阶段有表达差异的40个ncRNA做研究,Northern杂交分析40个ncRNA在家蚕五龄幼虫不同部位的表达谱,以期筛选到在丝腺特异表达的ncRNA,并对其功能研究,旨在研究ncRNA对丝腺发育的调控机理。主要结果如下:1.Northern杂交的方法研究前期筛选到的40个在家蚕不同发育阶段表达差异的ncRNA在五龄幼虫头、胸、尾、背板、腹板、丝腺的表达情况,6个在丝腺高丰度表达的ncRNA:Bm-18、Bm-51、Bm-86、Bm-101、Bm-152、Bm-159。2.选取丝腺表达丰度较高的ncRNA,对其宿主基因及上下游基因在家蚕五龄幼虫头、胸、尾、背板、腹板、丝腺的表达情况研究,发现内含子起源的snoRNA Bm-86与其宿主基因BGIBMGA007469-TA在丝腺的表达呈负的关系,另外一个unclassified ncRNA Bm-152与其互补链上的基因BGIBMGA007380-TA在丝腺的表达也呈负的关系,这些ncRNA可能调控其宿主基因或互补链上基因的表达来参与丝腺的发育调控。3.RT-PCR分析丝腺高丰度表达的ncRNA在丝腺的分布情况发现,在前、中、后丝腺中,Bm18、Bm51、Bm-86、Bm-101、Bm-152、Bm-159都有表达,其中其中Bm-51和Bm-152在丝腺三部位的表达量无太大变化;Bm-86和Bm-159在前部丝腺和后部丝腺的表达量较多于中部丝腺;Bm-18、Bm-101在前部丝腺表达量较多。4.分析丝腺高丰度表达的ncRNA在丝腺细胞核、质的表达情况,发现snoRNA Bm-51在细胞质里的表达量稍多于细胞核,Bm-51除了在细胞核中发挥功能,在细胞质中也可能也发挥一定的调控功能;而unclassified ncRNA Bm-152和Bm-159在核质都有表达且表达量无太大差别。关键词:家蚕论文非编码RNA论文丝腺论文Northern杂交论文表达谱论文

    致谢4-5

    目录5-7

    摘要7-8

    1 文献综述8-21

    1.1 非编码RNA 的分类和作用8-16

    1.1.1 小于 50nt 的非编码 RNA8-10

    1.1.1.1 microRNA8-9

    1.1.1.2 siRNA9-10

    1.1.1.3 piRNA10

    1.1.2 50nt 到 500nt 大小的中等 ncRNA10-15

    1.1.2.1 小分子核RNA(snRNA)10-11

    1.1.2.2 小胞浆RNA(scRNA)11

    1.1.2.3 核仁小分子RNA(snoRNA)11-15

    1.1.3 大于 500nt 的长链非编码 RNA15-16

    1.2 非编码RNA 研究技术16-18

    1.2.1 生物信息学方法预测新ncRNA16

    1.2.2 ncRNA 的测序鉴定16-17

    1.2.2.1 测序16

    1.2.2.2 cDNA 文库测序16-17

    1.2.3 生物芯片分析17

    1.2.4 基因组SELEX 技术17-18

    1.2.5 功能性的RNA 组学方法18

    1.3 昆虫非编码RNA 的研究进展18-19

    1.4 家蚕丝腺研究进展19-21

    1.4.1 家蚕丝腺结构和生理功能19-20

    1.4.2 家蚕丝腺基因研究进展20-21

    2 引言21-22

    2.1 研究目的和21

    2.2 研究内容21-22

    3 和方法22-33

    3.1 实验器材与试剂22-24

    3.1.1 实验22

    3.1.2 实验仪器22

    3.1.3 实验试剂及溶液配制22-24

    3.1.3.1 主要药品与试剂22-23

    3.1.3.2 试剂配制23-24

    3.2 主要实验方法24-33

    3.2.1 引物设计24-25

    3.2.2 家蚕组织中总RNA 的提取25

    3.2.3 RNA 的纯化25-26

    3.2.4 变性PAGE 电泳检测RNA26

    3.2.5 探针的合成26-28

    3.2.5.1 质粒的提取26-27

    3.2.5.2 质粒载体线性化27

    3.2.5.3 酶切产物纯化回收27-28

    3.2.5.4 体外转录合成探针28

    3.2.6 Northern 杂交28-29

    3.2.6.1 RNA 样品的变性PAGE 电泳28

    3.2.6.2 转膜28

    3.2.6.3 RNA 的紫外交联28-29

    3.2.6.4 预杂交29

    3.2.6.5 杂交29

    3.2.6.6 洗膜29

    3.2.6.7 压片、29

    3.2.7 宿主基因的RT-PCR29-30

    3.2.7.1 cDNA 条链的合成29-30

    3.2.7.2 PCR 反应30

    3.2.8 非编码RNA 的RT-PCR30-32

    3.2.8.1 RNA 去磷酸化30

    3.2.8.2 去磷酸化产物的trizol 纯化30-31

    3.2.8.3 RNA 的3’加接头的方法31

    3.2.8.4 反转录和cDNA 合成31-32

    3.2.9 DNA 琼脂糖胶电泳32

    3.2.10 丝腺细胞核、质 RNA 的分离32-33

    4 结果与分析33-42

    4.1 Northern 分析ncRNA 在家蚕组织的差异33-35

    4.1.1 家蚕不同组织部位总RNA 的提取及定量33

    4.1.2 Northern 探针的制备及质量检测33-35

    4.1.3 丝腺高丰度表达非编码RNA 的筛选35

    4.2 丝腺高丰度表达的ncRNA 在前、中,后丝腺的分布情况35-38

    4.3 丝腺高丰度表达的ncRNA 与宿主基因之间的关系38-39

    4.4 丝腺高丰度表达的ncRNA 在丝腺细胞核、质的表达分析39-42

    5 结果与讨论42-45

    5.1 结果42

    5.2 讨论42-45

    5.2.1 丝腺高丰度表达ncRNA 的筛选43-44

    5.2.2 丝腺高丰度表达ncRNA 在丝腺中的分布44-45

copyright 2003-2024 Copyright©2020 Powered by 网络信息技术有限公司 备案号: 粤2017400971号