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摘要：寡突胶质细胞是一类重要的神经胶质细胞,主要分布于高等脊椎动物中枢神经系统。它的主要功能是形成髓鞘结构,推动神经细胞的电信号传导,为神经细胞提供必要的营养及支撑。寡突胶质细胞的异常发育,将使中枢神经系统的髓鞘化发生障碍,产生脱髓鞘疾病,甚至引起神经元损伤,导致精神类疾病以及脑肿瘤。本论文基于寡突胶质细胞的发育历程,以三种视角构建了相关的基因调控网络。其中,通过网络组元浅析(NCA),构建了寡突胶质细胞发育的动态调控网络；通过与microRNA微阵列以及预测的靶基因信息关联,构建了microRNA参与调控的基因互作网络；通过利用表达谱聚类及三种基序搜索算法(MM、Gibbs Sampler、Random Projection),构建了一个基于功能模块的基因调控网络。最后,文章结合寡突胶质细胞的发育历程,对网络进行了初步浅析,并对每一种网络中有着的部分相互作用联系,通过文献挖掘工作,给出了支持信息。关键词：寡突胶质细胞论文基因调控网络论文microRNA论文模块网络论文基序搜索论文
论文摘要6-7
ABSTRACT7-9
第一章 绪论9-15
第一节 寡突胶质细胞介绍9
第二节 少突胶质细胞的发育阶段9-10
第三节 髓磷脂与髓鞘的发育10-11
第四节 基因调控网络介绍11-14
第五节 工作流程14-15
第二章 寡突胶质细胞发育的动态调控网络15-26
第一节 网络组元浅析(NCA)算法介绍15-16
第二节 基因芯片的处理与浅析16-17
第三节 网络构建与结果17-20
第四节 动态网络的浅析20-26
第三章 microRNA关联的基因调控网络26-30
第一节 microRNA介绍26
第二节 microRNA调控的网络构建26-28
第三节 microRNA关联的调控网络浅析28-30
第四章 基于模块的调控网络30-40
第一节 基序搜索算法30-33
第二节 基因表达谱的聚类浅析33-35
第三节 基于功能模块的调控网络构建35-37
第四节 功能模块调控网络的浅析37-40
附录40-65
附录1 攻读学位期间发表的与学位相关的学术论文40-41
附录2. 661个差别表达的基因及其功能41-57
附录3. 15个差别表达的microRNA对应的预测靶基因57-61
附录4 30个模块的功能注释61-65