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云南少数民族彝族HLAⅡ类基因DQB1基因分型策略和基因多态性

收藏本文 2024-04-10 点赞:36000 浏览:161734 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:人类主要组织相容性抗原系统(Major Histocompatibipty Complex,MHC)即人类白细胞抗原系统(Human Leucocyte Antigen,HLA)位于人类第6号染色体的短臂(6p21.3),是人类基因组已知编码区中多态性最高、基因最复杂的遗传系统,其编码的细胞表面糖蛋白分子在机体的免疫识别、器官及骨髓移植、疾病性等医学研究以及在探讨人类起源、迁移和不同群体的遗传关系等人类学研究都的。对HLA-DQB1基因的PCR-SBT分型方法了改进研究,然后应用该方法对云南彝族了HLA-DQB1基因多态性研究。同时,把彝族和世界其他人群了HLA-DQB1基因频率的比较和聚类分析。在国际组织相容性工作组(International Histocompatibipty Working Group,IHWG)推荐的HLA-DQB1基因PCR-SBT方法的基础上,在HLA-DQB1基因的外显子的两侧的内含子内设计了一对外引物,将原方法改进为巢式PCR-SBT方法,并将测序引物选取在远离外显子5′端上游约190bp处。这样既提高了分型的灵敏性,节约了样品DNA用量,也大大增加了所测序列5′端的可读性。同时实践,借助于自动分型软件(AGP),改进的HLA-DQB1基因分型方法是精确度最高、分辨率最强的自动基因分型方法之一。应用该方法对云南68例彝族样本了HLA-DQB1基因分型研究,共准确地检测到13种等位基因,分别为DQB1*03011和DQB1*030921.01%;DQB1*0401占8.7%、DQB1*0402占8.7%;DQB1*0201和DQB1*0202各占7.97%;DQB1*0302和DQB1*03032各占7.25%;DQB1*0203、DQB1*030202和DQB1*030202各占1.45%。Hardy-Weinberg平衡检测,彝族人群中,杂合子频率的观察值小于期望值。这暗示了在彝族人群中可能存在某些隔离机制导致了基因在人群中非随机地遗传,如近亲繁殖或地理上的隔离造成。彝族群体HLA-DQB1基因的Evens-Watterson中性选择检测结果HLA-DQB1基因是遵循中性选择模式进化的。中华民族12个人群的HLA-DQB1等位基因频率的比较分析,在南北人群中HLA-DQB1等位基因频率的分布具有一定的规律性,这提示我国人群可以划分为南北两大类群。同时,以世界35个人群的HLA-DQB1等位基因频率为基础构建的系统树支持了我国人群可分为南方和北方两大类群的。关键词:HLA-DQB1论文遗传多态性论文基因频率论文SBT论文云南少数民族论文

    摘要6-7

    ABSTRACT7-9

    文献综述9-24

    章 HLA基因复合体研究进展9-19

    1.HLA系统简介9-12

    1.1 Ⅰ类基因区全长约1500kb9-10

    1.2 Ⅱ类基因区全长约1000kb10-11

    1.3 Ⅲ类基因区11-12

    1.4 HLA-Ⅰ类和HLA-Ⅱ类抗原的基因结构12

    2.经典的HLA-Ⅰ类和HLA-Ⅱ类抗原12-15

    2.1 经典的HLA结构12-13

    2.2 表达分布13-14

    2.3 生物学功能14-15

    3.HLA多态性及其产生、维持机制15-19

    3.1 HLA的多态性15-16

    3.2 HLA多态性的产生16-17

    3.3 HLA多态性的维持机制17-19

    章 HLA抗原基因分型方法的研究进展19-24

    1.HLA分型19

    2.HLA分型19-23

    2.1 血清学分型方法19-20

    2.2 细胞学分型20

    2.3 HLA基因分型方法20-23

    3.展望23-24

    云南彝族HLA-DQB1基因多态性的研究24-49

    章 HLA-DQB1基因的SBT方法24-36

    1.和方法24-30

    1.1 24-26

    1.2 方法26-30

    2 结果30-32

    2.1 PCR扩增结果30-31

    2.2 PCR产物测序结果31-32

    2.3 SBT分型结果32

    2 讨论32-35

    4 小节35-36

    章 云南彝族HLA-DQB1基因多态性的研究36-44

    1.和方法37-38

    1.1 样品的采集37

    1.2 基因组DNA提取37

    1.3 基因分型37

    1.4 统计分析37-38

    2.结果38-44

    2.1 云南彝族HLA-DQB1基因分型和等位基因频率38-40

    2.2 云南彝族HLA-DQB1基因的Hardy-Weinberg平衡检测40

    2.3 云南彝族HLA-DQB1基因的中性选择检验40-41

    2.4 少数民族HLA-DQB1等位基因分布的比较与分析41-44

    章 世界35个人群的HLA-DQB1基因的进化分析44-49

    1.和方法44-45

    1.1 44

    1.2 统计与分析方法44-45

    2 结果分析及讨论45-49

    2.1 世界各地人群的HLA-DQB1等位基因频率比较及基因系统演化树的分析及讨论45-46

    2.2 中华民族13个人群HLA-DQB1基因及信息46-49

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